【输血学基础】血小板制剂储存过程中的全转录组分析

血小板是无核血细胞，含有多种RNA。我们通过研究血小板制剂（platelet concentrates, PCs）在储存期间整个转录组表达谱的变化，探索血小板储存损伤的生物学功能和生物标志物。从8名健康献血者单采采集血小板，储存0～4天。血小板表型和功能分析用于检测储存期间的血小板活性。RNA测序用于检测储存期间PC中mRNA、lncRNA和circRNA表达的变化。应用GO和KEGG分析预测mRNA差异表达的功能分布。基因集富集分析用于分析基因通路的差异水平。最后，用聚合酶链反应（PCR）分析以验证3种mRNA（POLE2、DCUN1D4、DAD1）的表达。

通过RNA测序，共检测到10 767个mRNA、2 923个lncRNA和6 8550个circRNA。222 mRNA表达水平在储存0～4天发生了显著变化：58个持续增加，145个持续减少。差异表达的mRNA可能参与血小板活化、血小板聚集、内吞和凋亡等生理过程。1 413个lncRNA的表达水平是明显的，其中42种的水平上升，28种的水平下降。198种circRNA的表达水平发生显著变化，其中13种的表达水平持续变化。RNA测序显示的DAD1、DCUN1D4和POLE1 mRNA的差异表达水平通过PCR检测得到验证。血小板储存过程中mRNA、lncRNA和circRNA的变化可能与血小板储存损伤中的血小板凋亡和生理功能密切相关。DAD1、DCUN1D4和POLE1的表达水平可作为监测PC储存中血小板状态的生物标志物。

关键词：储存/血小板制剂；转录

原文献：Heililahong H, Jin P, Lei H, Gu H, Qian B, Wang X, Dai J, Cai X. Whole transcriptome analysis of platelet concentrates during storage. Blood Transfus. 2022 Feb 16. doi: 10.2450/2022.0291-21.

投稿人：刘威

投稿时间：2022-03-19